- ศูนย์บริการผลิตภัณฑ์สุขภาพเบ็ดเสร็จ (One stop Service Center; OSSC)
- กองผลิตภัณฑ์สุขภาพ นวัตกรรมและการบริการ
- กองยา
- กองควบคุมวัตถุเสพติด
- กองอาหาร
- กองผลิตภัณฑ์สมุนไพร
- กองควบคุมเครื่องมือแพทย์
- กองควบคุมเครื่องสำอาง และวัตถุอันตราย (กลุ่มควบคุม เครื่องสำอาง)
- กองควบคุมเครื่องสำอางและวัตถุอันตราย (กลุ่มวัตถุอันตราย)
- กองด่านอาหารและยา